人miRNA let7a2质粒的构建及其表达
作者:于春晓,胡晓燕,姜安丽 作者单位:山东大学 1. 医学院生物化学与分子生物学研究所, 济南 2. 附属省立医院耳鼻喉头颈外科, 济南3. 附属省立医院内分泌科, 济南【摘要】 目的 构建人miRNA let7a2真核表达质粒,检测其在肺癌细胞A549中的表达。方法 以人肺腺癌A549细胞总RNA为模板,将RTPCR扩增let7a2的前体(prelet7a2)序列, 克隆至pSilencer4.1CMV neo表达载体中,构建pSilencer4.1let7a2重组质粒,转染A549细胞,采用RTPCR法检测prelet7a2的表达;构建let7a2靶序列-报道基因融合质粒pMIRReportlet7a2T,与pSilencer4.1let7a2质粒共转染A549细胞,测定相对荧光素酶活性,以检测成熟let7a2在A549细胞中的表达及作用;采用MTT比色法检测pSilencer4.1let7a2转染对A549细胞增殖的影响。结果 构建的人let7a2真核表达质粒pSilencer4.1let7a2和let7a2靶序列-报道基因融合质粒pMIRReportlet7a2T经酶切及测序鉴定正确;pSilencer4.1let7a2质粒转染A549细胞后,RTPCR检测prelet7a2表达较对照组明显增强;MTT比色法显示let7a2对A549细胞增殖有抑制作用。pSilencer4.1let7a2 质粒和pMIRReportlet7a2T质粒共转染A549细胞后,通过报告基因检测相对荧光素酶活性较对照组降低,显示let7a2表达质粒转染A549细胞后,可有效表达let7a2并转变为成熟的具有生物学活性的let7a2。 结论 成功构建了人let7a2真核表达质粒,并在肺腺癌细胞A549中有效表达。
【关键词】 肺肿瘤; 基因表达调控; miRNA;let7a2
plasmid of microRNA let7a2 in lung cancer cells
GUAN Hengyun1, ZHANG Ju1, ZHANG Pengju1, CHEN Weiwen1, LIU Wenwen2,
YU Chunxiao3, HU Xiaoyan1, JIANG Anli1
(1. Institute of Biochemistry and Molecular Biology, School of Medicine, Shandong University, Jinan 250012, China;
2. Department of OtolaryngologyHead and Neck Surgery, Provincial Hospital Affiliated to Shandong University, Jinan 250021, China;
3. Department of Endocrinology, Provincial Hospital Affiliated to Shandong University, Jinan 250021, China)
To construct a recombinant eukaryotic expression plasmid of microRNA let7a2 and express it in lung cancer A549 cells. Methods let7a2 precursor sequence was amplified by RTPCR using RNA from A549 cells and was cloned into the pSilencer4.1 CMV neoexpression vector to produce the recombinant pSilencer4.1let7a2. Then the recombinant pSilencer4.1let7a2 was transfected into lung cancer A549 cells, and the prelet7a2 expression was verified by RTPCR. According to the miRBase Targets database, the target sequence of let7a2 was synthesized and inserted to the pMIRReport luciferase reporter vector to construct pMIRReportlet7a2T, which was cotransfected with pSilencer4.1let7a2 into A549 cells, and the relative luciferase activity was detected. The effect of let7a2 on A549 cell proliferation was tested by MTT. Results The results of DNA sequencing showed that sequences of pMIRReportlet7a2T and pSilencer5.1let7a2 were correct. RTPCR prelet7a2 was overexpressed in A549 cells after transfection of pSilencer4.1let7a2. Cotransfection of pSilencer4.1let7a2 and pMIRReportlet7a2T showed that mature let7a2 had biological activity. MTT results indicated that let7a2 inhibited proliferation of the transfected A549 cells. Conclusion The eukaryotic expression plasmid of let7a2 was successfully constructed and effectively expressed in A549 cells.
Key words: Lung neoplasms; Gene expression regulation; miRNA; Let7a2 新近研究发现[12],miRNA在人类的多种疾病,包括肿瘤的病理过程中都发挥重要作用。 miRNA既可作为抑癌基因下调原癌基因活性,也可作为癌基因下调抑癌基因活性,还可调节肿瘤相关基因的表达,其自身突变、缺失、易位及相互调控异常,还可导致相关基因异常表达。对miRNA的深入研究可探索肿瘤发生发展的分子机制,并可为肿瘤的临床诊断与治疗提供新的靶点。let7 miRNA是最早被发现的miRNAs之一,最近的研究[3]已经证明在肺癌中其表达低水平。 Takamizawa等[4]发现肺癌患者的let7表达显著降低,并且导致患者更差的预后,非小细胞肺癌患者的let7表达水平越低,其预后越差,术后生存期越短。体外组织培养实验表明,在人的肺癌细胞中瞬时的表达let7可以抑制细胞的增殖,这也说明let7在肺组织中可能是一个抑癌基因。本研究通过构建let7a2的真核表达载体,转染肺癌细胞,以RTPCR方法检测let7a2在A549细胞中的表达情况,为进一步研究let7a2在肺癌中的生物学功能奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料 pSilencerTM4.1CMV neo载体、pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control载体、pMIRREPORTTM Luciferase载体、pMIRREPORTTM βgal Control载体购自Ambion公司; URIzol试剂、质粒抽提试剂盒由Invitrogen公司提供; 限制性内切酶、T4DNA连接酶、Taq酶、PCR试剂盒系大连宝生物工程公司生产;MMLV 逆转录酶试剂盒购自Promega公司;大肠杆菌JM109由本室保存,肺腺癌细胞株A549购自中科院上海细胞所; F12K培养基,新生牛血清购于Gibco公司。
1.2 方法
1.2.1 PCR扩增 prelet7a2基因 根据prelet7a2基因序列设计引物,上游引物:let7a2F 5′CCCGGATCCCATTGTGACTGCATGCTCC3′;下游引物:let7a2R 5′CCCAAGCTTGTTGTTTAGTGCAAGACCC3′用TRIzol一步法提取人肺腺癌细胞A549总RNA,用随机6聚体引物和MMLV逆转录酶将细胞总RNA逆转录为cDNA, 以cDNA为模板, 以let7a2F和let7a2R为引物,PCR扩增prelet7a2基因。 PCR条件: 94?℃ 2?min,94?℃ 30?s,60?℃ 30?s,72?℃ 20?s,35个循环, 最后72?℃ 10?min。
1.2.2 let7a2表达质粒pSilencer4.1let7a2的构建 RTPCR产物经凝胶电泳分离, 凝胶回收试剂盒回收目的片段,用BamH Ⅰ和Hind Ⅲ酶切回收片段, 与pSilencerTM4.1CMV neo载体连接构成pSilencer4.1let7a2表达质粒,限制性酶酶切及测序鉴定阳性重组体。
1.2.3 let7a2靶序列-报道基因融合质粒的构建 构建let7a2靶序列-报道基因融合质粒与let7a2表达质粒共转染细胞,通过报告基因检测pSilencer4.1let7a2质粒的表达及其作用。根据miRBase Targets数据库,查找haslet7a2靶序列(UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU),人工合成其DNA序列及其互补序列,两端分别加Hind Ⅲ和Sac Ⅰ酶切位点。7a2TF: 5′AGCTTTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT
GAGCT 3′; 7a2TR: 3′ AACTCCATCATCCAACATATC
AAC 5′。等摩尔比混合两条链,95?℃加热5?min,自然冷却至室温。将退火双链克隆至pMIRReportTM Luciferase载体中构成let7a2靶序列-报道基因融合质粒pMIRReportlet7a2T。限制性酶酶切及测序鉴定阳性重组体。
1.2.4 细胞培养及转染实验 为检测pSilencer4.1let7a2质粒的表达,肺癌A549细胞接种于25?mL培养瓶, 用含10%小牛血清、100?U/mL青霉素及100?U/mL链霉素的F12K培养基,37 ?℃、5% CO2条件下培养。当细胞融合度>80%时,换用2?mL无抗生素F12K培养基, 用FuGENE HD转染细胞,每瓶8?μL FuGENE HD+2?μg pSilencer4.1let7a2质粒+100?μL OptiMEM。对照组转染等剂量pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control载体。
为检测pSilencer4.1let7a2质粒的表达及其对靶序列的作用,肺癌A549细胞接种于24孔板中,用含10%小牛血清、100?U/mL青霉素及100?U/mL链霉素的F12K培养基,37?℃、5% CO2条件下培养至80%~90%融合度,换用无抗生素F12K培养基(0.5?mL/孔),用FuGENE HD转染细胞(4复孔),每孔1?μL FuGENE HD+0.2?μg pSilencer4.1let7a2+0.3?μg pMIRReportlet7a2T+0.03?μg pMIRReport βgal Control+25?μL OptiMEM。对照组转染等剂量 pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control载体或pMIRReportTM Luciferase 空载体。
1.2.5 RTPCR检测let7a2在肺癌A549细胞中的表达 肺癌A549细胞在转染pSilencer4.1let7a2 质粒48?h后, 用TRIzol一步法提取细胞总RNA,用随机6聚体引物和MMLV逆转录酶将细胞总RNA逆转录为cDNA, 以cDNA为模板, PCR扩增prelet7a2片段。PCR引物为: F 5′CATTGTGACTGCATGCTCC 3′,R 5′GTTGTTTAGTGCAAGACCC 3′。内参照5SRNAF 5′TACGGCCATACCACCCTGAA 3′, 5SRNAR 5′TAACCAGGCCCGACCCTGCT3′,PCR反应条件同前, 1.5%琼脂糖电泳检测PCR产物,凝胶成像系统采集图像。
1.2.6 荧光素酶活性测定 按试剂盒(Promega)说明书操作,弃掉细胞培养基,PBS冲洗细胞1次,加入1×RLB裂解液,放置室温10?min后,吹打细胞,收集细胞裂解液。荧光素酶活性测定:荧光测定管中加100?μL LAR II(luciferase assay reagent),再加细胞裂解液20?μL,放置发光仪中,测定pMIRREPORT(tm)中的firefly荧光素酶活性,读数为M1。β半乳糖苷酶活性测定:30?μL细胞裂解液+20?μL 1×RLB裂解液+50?μL 2×AB检测缓冲液,37?℃保温30?min,加150?μL 1?mol/L碳酸钠终止反应,420?nm检测,计算得到的β半乳糖苷酶活性为M2。用M1/M2比值表示相对荧光素酶活性。
1.2.7 MTT比色法检测细胞增殖 取生长状态良好的细胞, 等密度接种于24孔板中, 培养至大于80%融合度时,按上述方法转染细胞,每孔1?μL FuGENE HD+0.5?μg pSilencer4.1let7a2质粒+25?μL OptiMEM。对照组转染等剂量 pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control载体。转染12?h后,用1?mL培养基悬浮细胞,稀释5倍后接种于96孔板(6复孔),培养24~48?h后, 每孔加入10?μL MTT(5?mg/mL),继续培养4?h。弃上清液,每孔二甲亚枫100?μL脱色,于570?nm检测吸光度。
2 结 果
2.1 let7a2表达质粒pSilencer4.1let7a2的酶切鉴定及测序 RTPCR扩增prelet7a2产物经纯化,克隆至pSilencer4.1CMV neo载体,构成重组质粒pSilencer4.1let7a2,经限制性内切酶BamHⅠ和Hind Ⅲ酶切后,电泳显示:得到2个片段,分别为112?bp的prelet7a2和4?944?bp的线性pSilencer4.1CMV neo载体,见图1。结果与理论值相符。pSilencer4.1let7a2测序结果:CATTGTGACTGCATGCTCCCAGGTTGAGGT
AGTAGGTTGTATAGTTTAGAATTACATCAAGGGAGAT
AACTGTACAGCCTCCTAGCTTTCCTTGGGTCTTGCAC
TAAACAAC,其结果与Genebank中序列完全一致。
pSilencer4.1let7a2重组质粒的酶切电泳鉴定
1:pSilencer4.1let7a2经BamHⅠ和Hind Ⅲ酶切得到112?bp和4?944?bp的片段
2:DNA分子量标准
Fig.1 Electrophoresis of pSilencer4.1let7a2 recombinant digested by restriction enzymes
1: pSilencer4.1let7a2 recombinant digested by BamHⅠand Hind Ⅲ, generating prelet7a2 (112?bp) and linear pSilencer4.1 CMV neo vector (4?944?bp)
2: DNA marker
2.2 let7a2靶序列-报道基因融合质粒酶切鉴定及测序 根据haslet7a2靶序列, 人工合成其DNA序列及其互补序列,两端分别加Hind Ⅲ和Sac Ⅰ酶切位点,克隆到pMIRReportTM Luciferase载体中构成let7a2靶序列-报道基因融合质粒pMIRReportlet7a2T,经Mlu Ⅰ酶切鉴定,电泳分析显示:重组质粒pMIRReportlet7a2T不能被Mlu Ⅰ开环;对照空质粒pMIRReportTM Luciferase可被Mlu Ⅰ开环,得到6?470?bp大小的片段, 结果与理论值相符合,见图2。pMIRReportlet7a2T测序结果正确(测序结果略)。
2.3 let7a2表达质粒在肺癌A549细胞中的表达 pSilencer4.1let7a2瞬时转染肺腺癌A549细胞, 对照组转染等剂量 pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control载体。48 ?h后, 用TRIzol一步法提取细胞总RNA,RTPCR扩增prelet7a2片段。内参为5SRNA。电泳结果显示:pSilencer4.1let7a2质粒在A549细胞中表达明显增强,A549细胞本身有一定量的prelet7a2表达,见图3。pMIRReportlet7a2T重组质粒酶切电泳鉴定
1:DNA分子量标准
2:pMIRReportTM Luciferase载体经Mlu Ⅰ酶切得到6?470?bp?片段
3:pMIRReportlet7a2T重组质粒不能被Mlu Ⅰ切开
Fig.2 Electrophoresis of pMIRReportlet7a2T recombinant digested by restriction enzymes
1: DNA marker
2: pMIRReportTM Luciferase vector digested by Mlu Ⅰ, generating a linear pMIRReportTM Luciferase vector (6?470?bp)
3: pMIRReportlet7a2T recombinant digested by Mlu Ⅰ
RTPCR检测prelet7a2在A549细胞中的表达
1:DNA分子量标准
2:转染pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control载体后,prelet7a2在A549中的表达
3:转染pSilencer4.1let7a2重组质粒后,prelet7a2表达增强。
Fig.3 Electrophoresis of prelet7a2 amplified by RTPCR
1: DNA marker
2: prelet7a2 in A549 cells transfected with pSilencerTM4.1CMV neo negative control vector
3: prelet7a2 in A549 cells transfected with pSilencer4.1let7a2 plasmid
2.4 let7a2表达质粒对let7a2靶序列的作用 pSilencer4.1let7a2质粒和pMIRReportlet7a2T质粒共转染A549细胞,对照组转染等剂量pMIRReportTM Luciferase 空载体。测定pMIRREPORT(tm)中的firefly荧光素酶活性M1和β半乳糖苷酶活性M2, 计算M1/M2比值表示相对荧光素酶活性。结果显示:pSilencer4.1let7a2 和pMIRReportlet7a2T共转染组较对照组pSilencer Negative Congtrol和pMIRReportlet7a2T共转染组其相对荧光素酶活性明显降低。转染等剂量 pMIRReportTM Luciferase 空质粒的对照组,荧光素酶活性无明显变化,见图4。
A549细胞中let7a2相对荧光素酶活性
A:pSilencer4.1let7a2 和pMIRReportlet7a2T共转染
B:pSilencer Negative Congtrol和pMIRReportlet7a2T共转染
C:pSilencer4.1let7a2和pMIRReportTM Luciferase vector共转染
D:pSilencer Negative Congtrol和pMIRReportTM Luciferase vector共转染
Fig.4 Measurement of relative luciferase activity of let7a2 in A549 cells
There are four cotransfected group:
A: pSilencer4.1let7a2 and pMIRReport
let7a2T cotransfected
B: pSilencer Negative Congtrol and pMIRReportlet7a2T cotransfected
C: pSilencer4.1let7a2 and pMIRReportTM Luciferase vector cotransfected
D: pSilencer Negative Congtrol and pMIRReportTM Luciferase vector cotransfected
2.5 let7a2表达质粒对肺癌A549细胞增殖的影响 A549细胞转染 pSilencer4.1let7a2 质粒,对照组转染等剂量 pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control。分别于24、48?h后,用MTT比色法于570?nm检测吸光度。结果显示:转染pSilencer4.1let7a2组较对照组转染pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control的活细胞数明显减少,分别减少12%(24?h)和15%(48?h),见图5。
3 讨 论
肺癌是世界上导致死亡的主要肿瘤之一,其A549细胞转染pSilencer4.1let7a2重组质粒或者pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control载体后,24、48?h细胞活性。
Fig.5 After transfected with pSilencer4.1let7a2 (blank bars) or pSilencerTM4.1CMV neo Negative Control (grey bars), A549 cell alivaty in 24 to 48 ?h
病因主要是遗传性因素和吸烟导致的。最近的研究显示:人类的许多疾病,像肠癌,慢性淋巴细胞白血病和脆性X综合征等与miRNA有密切关系[59]。在许多肿瘤中,miRNA的表达有显著的改变,由此可作为一种疾病诊断的工具[10]。let7 miRNA家族被认为在肿瘤抑制中发挥作用,研究发现在非小细胞肺癌(NSCLC)中let7 家族呈现低表达[11]。
let7最早在线虫中发现,存在于多种物种中,具有许多同源序列统称为let7家族,它们大多定位于9、l1、22号染色体上。let7a2是这个家族的成员之一,其基因定位于染色体11q24.1。成熟的人类 let7a2分子具有22?bp,其前体序列具有72?bp。Johnson等[12]报道肺癌组织let7miRNA减少,RAS蛋白增加,RAS基因的3′UTR区包含有多个与let7互补的位点,因此,RAS基因可能是let7调控的靶基因之一,let7通过抑制RAS蛋白的表达进而抑制肿瘤细胞恶性生长。
miRNA的生成具有一个由细胞核到细胞质的过程。首先,在细胞核中miRNA基因转录成初级产物(primiRNA),这个初级转录产物被RNase Ⅲ Drosha切割成为具有发夹结构约70~90?bp大小的单链RNA前体 (premiRNA),它需要在转运蛋白exportin5的作用下由核内转到胞质中[13]。在细胞质中,premiRNA被RNase Ⅲ Dicer进一步切割产生成熟的miRNA,通过与其靶mRNA分子的3′端非编码区域(3′untranslated region, 3′UTR)互补匹配导致该mRNA分子的降解或者蛋白翻译的抑制[14],来调控基因表达,产生基因沉默。
本研究以人肺腺癌细胞A549总RNA为模板,根据prelet7a2基因序列设计引物,采用RTPCR方法,扩增其前体序列prelet7a2并将其插入到pSilencer4.1CMV neo表达载体中,经BamHⅠ和Hind Ⅲ酶切及DNA测序确定其序列完全正确后,重组体转染A549细胞, RTPCR在mRNA水平检测let7a2的表达情况,根据miRBase Targets数据库,查找haslet7a2靶序列,人工合成其DNA序列,构建报告基因融合质粒pMIRReportlet7a2T,经Mlu Ⅰ酶切鉴定及DNA 测序正确后,与pSilencer4.1let7a2共转染A549细胞,在报告基因表达水平检测成熟let7a2 在细胞中的形成及作用;最后用MTT比色法检测let7a2对A549细胞增殖的影响。
为表明构建的let7a2表达载体在肺癌细胞中的表达情况,本研究从3个方面来验证:① 用RTPCR方法检测prelet7a2的表达情况; ② 用报告基因方法检测成熟let7a2对其靶序列的作用;③ 用MTT比色法检测let7a2对细胞生长的作用。通过此3方面的检测,本研究结果表明:构建的真核表达载体pSilencer4.1let7a2可在肺癌细胞A549中有效表达,表明通过它们转染细胞可用于其功能研究。此结果为今后进一步研究haslet7a2在肺癌发生发展中的作用提供了实验基础。
【参考文献】
[1] Fabbri M, Croce C M, Calin G A. MicroRNAs[J]. Cancer J, 2008, 14(1):16.
[2] Zhang B, Pan X, Cobb G P, et al. microRNAs as oncogenes and tumor suppressors[J]. Dev Biol, 2007, 302(1):112.
[3] Fang W J, Lin C Z, Zhang H H, et al. Detection of let7a microRNA by realtime PCR in colorectal cancer: a singlecentre experience from China[J]. J Int Med Res, 2007, 35(5):716723.
[4] Takamizawa J, Konishi H, Yanagisawa K, et al. Reduced expression of the let7 microRNAs in human lung cancers in association with shortened postoperative survival[J]. Cancer Res, 2004, 64(11):37533756.
[5] Calin G A, Dumitru C D, Shimizu M, et al. Frequent deletions and downregulation of microRNA genes miR15 and miR16 at 13q14 in chronic lymphocytic leukemia[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2002, 99(24):1552415529.
[6] Caudy A A, Myers M, Hannon G J, et al. Fragile Xrelated protein and VIG associate with the RNA interference machinery[J]. Genes Dev, 2002, 16(19):24912496.
[7] McManus M T. MicroRNAs and cancer[J]. Semin Cancer Biol, 2003, 13(4):253258.
[8] Calin G A, Sevignani C, Dumitru C D,et al. Human microRNA genes are frequently located at fragile sites and genomic regions involved in cancers[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2004, 101(9):29993004.
[9] Calin G A, Ferracin M, Cimmino A, et al. A MicroRNA signature associated with prognosis and progression in chronic lymphocytic leukemia[J]. N Engl J Med, 2005, 353(17):17931801.
[10] Lu J, Getz G, Miska E A, et al. MicroRNA expression profiles classify human cancers[J]. Nature, 2005, 435(7043):834838.
[11] Kumar M S, Erkeland S J, Pester R E, et al. Suppression of nonsmall cell lung tumor development by the let7 microRNA family[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2008, 105(10):39033908.

