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药物化学结构式图形资源系统的构建与应用
 

药物化学结构式图形资源系统的构建与应用

2011-08-23 访问量:322
作者:姜 楠,董鸿晔,金 杰,郑月圆 作者单位:沈阳药科大学(辽宁 沈阳 110016)

  【摘要】 目的:本文阐述了药物化学图形资源系统开发意义、设计方法及构建网络应用平台的全过程。方法:本系统以Eclipse-JAVA语言平台作为开发环境,以SQL Server 2005数据库作为图形数据存储工具,利用面向对象技术和图形处理技术,设计了基于B/S结构的“药物化学结构式图形资源系统”。结果:本系统实现了药物化学结构式图形及信息的分类存储、按药物的名称、性状等信息分类的快速检索及按药效分类的模糊查询等功能。结论:系统具有用户界面友好,使用便捷,内容丰富、支持多种查询方式等特点,为药学工作者带来了方便。

  【关键词】 药物化学;结构式图形;数据库;可视化查询;计算机网络

  Construction and Applicatio of Graphics Visual System

  for Pharmaceutical Chemistry

  Jiang Nan,et al

  Shenyang Pharmaceutical University(110016)

  Abstract:Objective:This paper mainly introduces the development,design and construction of graphic visual system for pharmaceutical chemistry,and the front page the background database of the entire process.Methods:including the construction of computer environment,new perspective for web pages design,and the method of using the graphic system and its advantages.This paper mainly introduces the visualization system of Medicinal Chemistry,which uses the Eclipse-JAVA language and SQL Server 2005 database as a background database.Results:The system offer online real-time retrieval service of Medicinal Chemistry structured graphics,access to drug-related Chinese name,English name,IUPAC name and other functions.Medicinal chemistry graphic visualization system is a computer network technology used in pharmacy,which combines visualization and graphics.After a complete system test,it shows that the system has a user-friendly,simple,and accurate information.Users who inquires the chemical structure of drugs,only need to input the Chinese name,English name,IUPAC name and molecular formula of any kind or classification in accordance with the efficacy of drugs and then the system will be able to search quickly and accurately related to the given structured graphics,as well as the other drug information.Conclusion:The system advanced the pharmaceutical research,facilitating the pharmaceutical workers.

  Key words:Medicinal Chemistry;Visualization of Graph;Database;Computer Network

  引言药物化学是建立在化学、医学、生物等学科基础上,设计、合成新的活性化合物,研究构效关系,解析药物的作用机理,创制并研究用于预防、诊断和治疗疾病药物的一门学科[1]。由于其设计、合成新化合物的需要,药物化学工作者要查询大量的化学结构式及其信息,但由于药物复杂多样,新药的研发速度较快,资料的分散度较高,传统的手工检索给化学结构式的查询带来诸多困难[2]。因此,应用药学信息技术及计算机网络技术构建药物化学结构式资源系统,以满足日益快速发展的信息检索及资源共享需求就成为亟待解决的热点之一。

  1 系统功能概述

  药物化学结构式图形资源系统采用目前开放的、可扩展的Eclipse-JAVA集成环境作为开发平台,以便使各种软件开发工具完美地集成在一起[3]。采用Microsoft SQL Server 2005数据库存储工具存储药物结构式及相关信息,基于B/S结构,利用JSP技术实现网页开发,可实现药物化学相关药物名称、性状及结构式的网上快速检索和资源共享等功能。该系统在Windows2003 Server平台上运行。利用Microsoft SQL Server 2005 Enterprise Edition对数据库进行管理。系统设计模型如图1所示,系统查询流程如图2所示。

  2 系统数据库设计

  药物化学结构式图形资源系统数据库是基于Microsoft SQL Server 2005数据库开发工具构建,用于存储药物化学结构式图形信息以及和结构式有关的药物名称、性状、类别等信息以及用户信息。该工具是微软公司提供的新一代数据管理和分析解决方案,它给应用数据和分析程序带来更好的安全性、稳定性和可靠性,能够在多个平台、程序和设备之间共享数据,更易于与内部和外部系统连接[4]。由于药物化学结构式图形资源数据量较大,本着减少存储空间和检索时间的原则,设计了数据表结构见表1和药效分类见表2。图1 药物化学结构式图形资源系统模型图2 系统查询流程图表1 数据表结构表2 药效分类

  3 网页及用户界面设计与使用

  本系统采用JSP(Java Server Pages)技术实现网页开发。JSP技术是用Java语言作为脚本语言的,相对于其他动态网页技术 JSP具有很好地解决跨平台问题的巨大优势,已经成为当今动态网页开发的流行技术[5]。

  药物化学结构式图形资源系统的网页用户界面采用网页框架结构设计,然后通过网页框架在互联网中寻找PSD分层素材,再通过网页切片功能实现框架的形成,最后通过代码设计实现与数据库和网页的整体连接。网页设计流程与实现方法如图3所示。图3 网页设计流程图药物化学结构式图形资源系统首页界面如图4所示。图4 系统首页

  该界面提供两种查询方式:①在输入框中直接输入所要查询药物的中文名、英文名、IUPAC名、分子式的任意一种信息,点击“提交”按钮,可按分类查询得到所需的信息,如图5所示;②通过下拉菜单,选择不同的药物作用效果。点击“提交”按钮,可按药效分类实现模糊查询,在给出相应的查询信息后点击所要查看药物的行末的“查看”链接,可得到该药的所有药物信息和结构式,查询结果如图6所示。图5 药物分类查询结果图6 药物模糊查询结果

  结论

  药物化学结构式图形资源系统是将药学信息与计算机网络技术相结合,应用于药学研究的过程。该系统实现了药物化学结构式图形及信息的分类存储、按药物的名称、性状等信息分类的快速检索及按药效分类的模糊查询等功能。该系统以网页为表现形式,直观而具有很强的亲和力,经测试表明,系统具有用户界面友好,使用便捷,内容丰富、支持多种查询方式等特点,为药学工作者带来了方便。

  【参考文献】

  [1] Williams D A,Lemke T L.Foye's principles of medicinal chemistry.5th de.Philadelphia:Lippincott Willams&Wilkins,2002.

  [2] 汤韧,张宜,易涛.药学信息技术[J].药学服务与研究,2003,3(4):210-213.

  [3] 严武文,张国伟,杨建 基于Eclipse-Java语言的格构梁内力计算程序[J].山西建筑,2009,35(9):362.

  [4] 梁冰,陈丹丹,苏宇 SQL语言参考大全[M].人民邮电出版社 2008-10-1 2-4.

  [5] 赛奎春,安剑,冯娜等.JSP开发技术大全[M].人民邮电出版社(北京);2007,448-489.

 
 

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